如果是扣除五险一金后的工资是5000元，则应纳个人所得税是45元。计算过程如下：1，起征点是3500元，所以应纳税所得额是：5000-3500=1500元2，工资薪金个人所得税实行超额累进税率，如下图：
1500元不超过1500，属于第1级，税率3%，速算扣除数0，所以，应纳税额为：1500×3%-0=45元
