白塞氏病目前尚无有效的根治方法。药物虽然不能根治疾病，但是只要接受正规治疗，是能够缓解症状，控制病情发展的。本病的治疗药物主要有以下几种：
(1)糖皮质激素：是白塞氏病的主要治疗药物，可以减轻各种症状，尤其能够改善粘膜溃疡和关节疼痛，对有眼部受损和中枢神经受损者宜及时应用较大剂量。
(2)免疫抑制剂：是治疗白塞氏病的另一个重要药物，可以阻止疾病进展，与糖皮质激素有协同作用，并能减少糖皮质激素的用量。常用的有环磷酰胺、氨甲喋呤、硫唑嘌呤等。此外还有环孢霉素A，对眼病有效，但停药后症状易复发。
(3)抗结核药物：有结核病者要积极抗结核治疗。部分白塞氏病病人经抗结核治疗后病情缓解。
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