A、离子是指带电的原子或原子团，故A错误；B、原子是化学变化中的最小微粒，而不是最小的微粒，故B错误；C、原子是化学变化中的最小微粒而不是分子，故C错误；D、分子、原子、离子都是构成物质的粒子，故D正确．故选：D．
