我们家78平方吧,户口上6个人,三个家庭生活在一套房里,想申请经适房,是分开申请,还是一起提出申请啊?

不管你们这个家庭成员关系有多少复杂，实际情况是一个家庭，租赁了一套廉租房。
上海经济适用房准入条件：
1. 户口：“家庭成员必须具有本市常住城镇户口7年以上，并且在申请区5年以上”
有几个满足这个条件，就按几个人的住房标准申请；
2. 人均面积: "人均建筑面积15平方米以下"
建筑面积/符合申请条件的人口。如果是78/6，可以申请；如果78/5，就不够申请条件了。
3. 月收入: "人均年可支配收入低于27600元，人均财产7万元以下 " [实际执行标准放宽了]
4. 住房交易: "申请人申请经济适用住房前5年内未发生过住房交易的行为，申请家庭成员之间住房赠与行为除外"
5. 上海经济适用房供应标准
单身人士、2人家庭: 可申购一居室
3人家庭、建面低于规定额的2人家庭: 可申购二居室
4人及以上家庭: 可申购三居室

你们的实际情况是78平米的建筑面积，尽管住了3代10口人，但是想多申购还是要符合规定条件才可以。

你们的问题是两个外来媳妇怎么办？三舅怎么办？
我的建议是2个外来媳妇够入籍上海条件后，再按规定申请廉租房；三舅如果能独立分户的话，先分户，然后独立申请廉租房。

以上，供参考。